До 1917 года под этим флагом проходили морские сражения и кругосветные плавания. Однако 18 ноября 1917 года на первом Всероссийском съезде военного флота было решено заменить Андреевский флаг на всех судах на красный стяг Интернационала.
27 мая 1935 года флаг ВМФ был изменён на белый флаг с красными серпом и молотом и синей полосой по нижней кромке. В советское время на кораблях ВМФ развевался государственный флаг СССР.
После распада СССР в 1991 году указом Президента РФ был введён исторический российский Андреевский флаг в качестве основного Военно-морского флага. Андреевский флаг всегда занимал особое место в русской символике. Он остаётся в сознании россиян гордым символом отечественной славы и доблести русского флота.